－1細胞完全長トータルRNAシーケンス法の開発に成功－ 要旨 理化学研究所（理研）情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニットの林哲太郎センター研究員、尾崎遼基礎科学特別研究員、二階堂愛ユニットリーダーらの研究チーム ※ は ...

RNA-seq解析をやってみたい。 論文も読みたいし、将来のキャリアにも役立ちそう。 こう感じている生命科学系研究者は非常に多いです。 この記事では、バイオインフォマティクス初学者がRNA-seq解析を始めるための現実的なステップを、実務視点で整理します。

理化学研究所（理研）生命医科学研究センタートランスクリプトーム研究チームのアレッサンドロ・ボネッティ客員研究員、ピエロ・カルニンチチームリーダーらの研究チームは、細胞核内のRNAとゲノムDNA（クロマチン[1] ）の相互作用をゲノム全体で調べる ...

RNA-seq解析を一通り経験すると、こんな疑問を持つ方が増えてきます。 「発現が変わったのは分かった。でも、なぜ変わったのかは分からない」 この「なぜ？」に一歩踏み込める解析手法が ATAC-seq です。 ATAC-seqは、遺伝子発現の“原因側”に近い情報を与え ...

ヒトゲノムはさまざまなRNA種をコードしているが、解明されていないものが多い。それらを既存のゲノムツールを用いて特定することは、いまだ困難だからである。本論文では、ほぼ全ての入力試料においてRNAポリメラーゼの位置をマップできるChRO-seq ...