理化学研究所（理研） 開拓研究本部 新宅マイクロ流体工学理研白眉研究チームの新宅 博文理研白眉研究チームリーダー、マハメッド・ナディ・アブデルモエズ 研修生、東京大学 大学院理学系研究科の小口 祐伴 特任助教、上村 想太郎 教授、京都大学 大学 ...

皆さんは日々増加するRNA-seqデータの解析に、どのようなツールを使っていますか？ 従来のツールでは複数サンプルを同時に分析する際に精度や効率の問題を抱えていませんか？ 本記事では、機械学習を活用した次世代RNA-seqアセンブラー「Aletsch（アレッチ ...

RNA-seq解析を始めようとすると、最初に直面する重要な選択があります。 「どのマッピングツールを使うべきか？」 HISAT2？ STAR？ それともSalmonやKallistoのような疑似アライメントツール？ この選択は研究結果の質、計算時間、必要なコンピュータリソースに ...

－1細胞完全長トータルRNAシーケンス法の開発に成功－ 要旨 理化学研究所（理研）情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニットの林哲太郎センター研究員、尾崎遼基礎科学特別研究員、二階堂愛ユニットリーダーらの研究チーム ※ は ...

理化学研究所（理研）生命医科学研究センタートランスクリプトーム研究チームのアレッサンドロ・ボネッティ客員研究員、ピエロ・カルニンチチームリーダーらの研究チームは、細胞核内のRNAとゲノムDNA（クロマチン[1] ）の相互作用をゲノム全体で調べる ...

生命科学の研究方法として、「シングルセル（単一細胞）解析」が大きな注目を浴びている。臓器に含まれる細胞を個別に解析していく研究方法であり、細胞集団を解析して平均値を捉えるこれまでの手法では見逃されてきた新しい細胞種、また、これまで ...

5種類のヒト培養細胞から新たな1,074種類の難溶性RNAを同定 早稲田大学理工学術院総合研究所次席研究員の曽超（ちぇんちゃお）、同大理工学術院 教授の浜田道昭（はまだみちあき）、熊本大学大学院生命科学研究部分子生理学講座 講師の中條岳志（ちゅう ...

初代ヒト組織や発生段階の細胞において、ありふれた遺伝的バリアントの機能を研究することは難しい。この問題に取り組むために、我々は効率的なマルチプレックス戦略を用いて、215のヒト誘導多能性幹細胞（iPSC）株をドーパミン作動性ニューロンを ...

東京慈恵会医科大学総合医科学研究センター分子遺伝学研究部の廣田朝光准教授、玉利真由美教授、同大学耳鼻咽喉科学教室の中島大輝大学院生、鴻信義教授、小島博己教授、獨協医科大学耳鼻咽喉・頭頸部外科学の中山次久教授らの共同研究グループは、患者に負担の少ない「鼻腔ブラッシング検体」を用い… ...

－病気の発見、予防、治療への糖鎖の利用を促進－ 国立研究開発法人 産業技術総合研究所（以下「産総研」という）細胞分子工学研究部門 多細胞システム制御研究グループ 舘野浩章 研究グループ長と、筑波大学大学院ヒューマンバイオロジー学位 ...

ゲノム解析サービスを提供する株式会社ジエンブル（本社：福岡県福岡市、代表取締役：竹添裕高）は、理化学研究所（埼玉県和光市 理事長：五神 真、以下理研） 生命機能科学研究センター バイオインフォマティクス研究開発チームら共同研究チームが ...

分裂酵母細胞が休眠から目覚める際の遺伝子の発現状態変化について解明した。 その結果、ヒストンH3遺伝子の変動が休眠打破に重要な役割を果たすことを明らかにした。 今後新たな制がん標的遺伝子の特定や、がん細胞の増殖を抑える創薬への道筋が期待 ...